ON NETWORK-BASED KERNEL METHODS FOR PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS WITH APPLICATIONS IN PROTEIN FUNCTIONS PREDICTION
Limin Limin, Li, Waiki, Ching, Yatming, Chan, Hiroshi Hiroshi, Mamitsuka · Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni · 2010
预言蛋白质功能是在 post-genomic 时代的一个重要问题。这份报纸学习包括本地线性嵌入的几个基于网络的内核(LLE ) 揭开的内核方法，散开内核和 laplacian 核在蛋白质函数和蛋白质蛋白质相互作用(PPI ) 之间的关系。作者首先基于 PPI 网络构造核，然后使用支持向量机器(SVM ) 技术分类蛋白质进不同的功能的组。5 褶层十字确认然后被用于选择了 359 去比较不同内核和数方法和 Chi 平方方法的 guilt-by-association 方法包括邻居的性能的术语。最后，作者进行一些未知基因的功能的预言并且验证我们的预言正确部分地由另外的数据的信息采购原料。