Substance graphs are optimal simple-graph representations of metabolism
Holme, Petter, Huss, Mikaël · 中国科学通报：英文版 · 2010
学习生物化学的系统宽的组织的一条途径是使用统计的图理论。在如此的重重地简化的方法，它不顾大多数生物化学的动态方面，一个人面临基本问题。一个如此的问题是化学反应系统怎么应该被归结为从原来的反应系统保留尽可能多的功能的信息的一张图。在这些图代表，边应该在底层和产品之间去，或底层和底层，或两个吗？顶点应该代表物质或反应吗？不同代表关于反应系统编码不同信息并且以不同的路影响网络措施。这份报纸调查哪个代表以最好的路反映新陈代谢的系统的功能的组织，根据定义标准。新陈代谢的四个不同的图代表(三在顶点是代谢物的地方，顶点是反应的) 从不同有机体和数据库用数据被评估。图代表被比较在簇(网络模块) 之间的重叠评估并且注解了函数，并且也由把识别货币代谢物的集合与其它写作的那些作比较鉴别了使用质的生物参数。鈥渟u bstance 联网鈥，这被发现吗？在参予反应的所有代谢物被连接的地方，比其它好，关于两个评估了在模块和功能之间并且到识别货币代谢物的数字和身份的功能的重叠。