Read error correction for IonTorrent data
Ершов Василий Алексеевич, Ershov Vasilii · Research Repository Saint Petersburg State University (Saint Petersburg State University) · 2017
Существующие быстрые и качественные алгоритмы коррекции ошибок в данных секвенирования генома предназначены для исправления ошибок, свойственных широко применяемой технологии секвенирования Illumina. В данной работе рассматривается задача исправления ошибок для другой распространенной технологии секвенирования IonTorrent. Приведено описание метода коррекции ошибок IonHammer. Разработана модификация данного алгоритма. Проведено сравнение новой версии алгоритма с предыдущей, а также другими методами исправления ошибок. Показано, что новая версия IonHammer превосходит альтернативы по скорости работы при сравнимом или более высоком качестве коррекции.