Approximate String Matching for Self-Indexes
Lukáš Hrbek, Jan Holub · 2016
Práce se zaměřuje na přibližné vyhledávání s nejvýše k chybami. Chyby jsou definovány s využitím Levenshteinovy vzdálenosti. Pro řešení této úlohy jsem navrhl filtrační algoritmus založený na pigeonhole principu. Prohledávaný text se předpokládá velký, implementovaný algoritmus proto používá FM-Index. Program je na poli vyhledávání v DNA srovnán s nástrojem BLAST. Experimenty ukázaly, že v některých aspektech je má implementace lepší.