Construction and Comparison of Drug-Disease Pathway Network for Drug Repositioning
Soyoun Hwang, Youhyeon Hwang, Min Oh, Youngmi Yoon · The Journal of Korean Institute of Information Technology · 2016
유전체 데이터가 지속적으로 증가함에 따라, 이를 사용하여 약물 작용 메커니즘을 밝히려는 다양한 연구가 진행되어왔다. 그러나 기존 연구들에도 불구하고 약물 작용 메커니즘은 아직 완벽하게 밝혀지지 않았다. 따라서, 본 연구에서는 약물 작용 메커니즘을 더 잘 이해하기 위하여 단백질 간의 상호작용 네트워크를 기반으로 약물-질병 유전자 네트워크를 구축하였으며, 이를 신약재창출에 적용하였다. 약물-질병 목록에 대해 경로 네트워크를 구축하기 위하여, 약물 표적 유전자에서부터 약물 관련 유전자를 경유하여 질병 관련 유전자에 도달하는 최단 경로 네트워크를 구축하였다. 약물-질병 목록들 중 치료 관계에 속하는 약물-질병 목록에 대하여 주요 유전자 네트워크를 추출하였다. 주요 유전자 네트워크와 치료 관계가 아닌 약물들에 대하여 구축한 후보 네트워크 사이의 유사도를 측정하여, 측정 결과 값에 따라 새로운 약물 적응증들을 예측하였다. 피셔의 정확성 검정을 통하여 예측한 약물 적응증들이 CTD 데이터베이스에서 수집한 치료 관계의 약물-질병 목록에 유의하게 포함되어 있음을 확인하였다 (Fisher