Homology modeling and evolutionary trace analysis of superoxide dismutase from extremophile Acidithiobacillusferrooxidans
刘元东, 王海东, 邱冠周 · Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Sunyatseni · 2007
在 Acidithiobacillus ferrooxidans 的基因草皮可以在它的忍耐起一个关键作用到简历沥滤的极其酸、有毒、氧化的环境。为进细菌的抗毒的机制的卓见，一三维(3D ) 这基因编码的蛋白质的分子的结构被为技术建模的相同造，由分子的动力学模拟精制了，由 PROFILE-3D 和 PROSTAT 节目估计了，它的关键残余被进化踪迹分析进一步检测。通过这些过程，一些踪迹残余被识别并且空间地聚类。在他们之中， Asn38， Glyl03 和 Glul61 的残余随机在整个印射的结构被散布；有趣地，另外的残余都清楚地在 Fe 原子附近在亚群被聚类。从这些结果，这基因能在 3D 水平被证实编码看情况 Fe 超级氧化物 dismutase 并且随后起一个抗毒的作用。而且，在 Fe 有约束力的地点附近的检测关键残余能被推测为 Fe 有约束力、催化的功能直接负责。