TMT: A tool to guide users in finding information on clinical texts

Fernando Aparicio, Manuel de Buenaga Rodríguez, Margarita Rubio, María Asunción Hernando, Diego Gachet Páez, Enrique Puertas, Ignacio Giráldez · Procesamiento del lenguaje natural · 2011

La gran cantidad de informacion medica disponible a traves de internet, tanto en formato estructurado como en formato texto, hace que los distintos tipos de usuario se encuentren con diferentes problemas a la hora de efectuar una busqueda efectiva. Por un lado, los estudiantes de medicina, el personal sanitario y los investigadores en el area de la biomedicina disponen de una gran variedad de fuentes y herramientas de caracteristicas dispares, que precisan de un periodo de aprendizaje a veces insalvable. Por otro lado, los pacientes, sus familiares y personas que no pertenecen a la profesion medica, se encuentran con el problema anadido que supone no estar suficientemente familiarizados con la terminologia medica. En este articulo presentamos una herramienta que permite extraer conceptos medicos relevantes presentes en un texto clinico, haciendo uso de tecnicas para el reconocimiento de entidades nombradas, aplicadas sobre listas de conceptos, y tecnicas de anotacion a partir de ontologias. Para proponer los conceptos se hace uso de un recurso no formal de conocimiento, como es Freebase, y de recursos formales como son Medlineplus y Pubmed. Nosotros argumentamos que la combinacion de estos recursos, con informacion menos formal y en lenguaje mas divulgativo (como es Freebase), con informacion formal y en lenguaje mas divulgativo (como es Medlineplus) o con informacion formal y en lenguaje mas especializado (como son las publicaciones cientificas de Pubmed), optimiza el proceso de localizacion de informacion medica sobre un caso clinico complejo a usuarios con diferentes perfiles y necesidades, tales como son los pacientes, los medicos o los investigadores. Nuestro objetivo ultimo es la construccion de una plataforma que permita albergar diferentes tecnicas para facilitar la practica de la medicina traslacional.

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